عُرف أوّل مسجد ضرار في الإسلام بعد بناء مسجد «قباء»، إذ قام المنافقون بتشييده لتفريق صفوف المسلمين، ودعوا إليه النبي صلى الله عليه وسلم، فرفض أن يجيبهم لما في فعلهم من تربّصن بوحدة المسلمين، وهنا نزل القرآن الكريم بما يكشف ذلك، فأمر عليه الصلاة والسلام بهدمه وحرقه، وفيه وفي مسجد «قباء» نزل قوله تعالى "وَالَّذِينَ اتَّخَذُوا مَسْجِدًا ضِرَارًا وَكُفْرًا وَتَفْرِيقًا بَيْنَ الْمُؤْمِنِينَ وَإِرْصَادًا لِمَنْ حَارَبَ اللَّهَ وَرَسُولَهُ مِنْ قَبْلُ وَلَيَحْلِفُنَّ إِنْ أَرَدْنَا إِلا الْحُسْنَى وَاللَّهُ يَشْهَدُ إِنَّهُمْ لَكَاذِبُونَ"، وأصل تعريف المسجد الضرار أنه: - أن يكون قد أقيم على الكفر والضلال لقوله تعالى "وكفرا"، أي بالنبي صلى الله عليه وسلم وبما جاء به. - أن يكون الغرض منه تفريق المؤمنين وتقليل جماعتهم وسوادهم لقوله تعالى "وتفريقا بين المؤمنين"، أي يفرقون به جماعتهم ليتخلف أقوام عن النبي صلى الله عليه وسلم لأنهم كانوا يصلون جميعا في مسجد «قباء»، وهذا يدل على أن المقصد الأكبر والغرض الأظهر من وضع الجماعة تأليف القلوب والكلمة على الطاعة وعقد الذمام والحرمة بفعل الديانة، حتى يقع الأنس بالمخالطة وتصفو القلوب من وضر الأحقاد، وتفطن «مالك» رحمه الله لهذه الآية فقال "لا تصلي جماعتان في مسجد واحد بإمامين، خلافا لسائر العلماء"، وقد روي عن «الشافعي» المنع، حيث كان تشتيتا للكلمة وإبطالا لهذه الحكمة وذريعة إلى أن نقول "من يريد الانفراد عن الجماعة كان له عذر فيقيم جماعته ويقدم إمامته فيقع الخلاف ويبطل النظام". - أن يكون مجمعا لأهل محاربة الله ورسوله وتضليل المؤمنين وإبعادهم عن دينهم الحق لقوله تعالى "وإرصادا لمن حارب الله ورسوله"، يعني «أبا عامر الراهب»، وسمي بذلك لأنه كان يتعبّد ويلتمس العلم، فمات كافرا بدعوة النبي صلى الله عليه وسلم، فإنه كان قال للنبي صلى الله عليه وسلم "لا أجد قوما يقاتلونك إلا قاتلتك معهم"، فلم يزل يقاتله إلى يوم «حنين»، فلما انهزمت «هوازن» خرج إلى الورم يستنصر، وأرسل إلى المنافقين وقال "استعدوا بما استطعتم من قوة وسلاح وابنوا مسجدا فإني ذاهب إلى قيصر فآت بجند من الروم لأخرج محمدا من المدينة"، فبنوا مسجد الضرار، وقوله تعالى "من قبل"، يعني من قبل بنائهم ذلك المسجد، وذلك أن «أبا عامر» هو الذي كان حزب الأحزاب، يعني حزب الأحزاب لقتال رسول الله صلى الله عليه وسلم، فلما خذله الله لحق بالروم يطلب النصر من ملكهم على نبي الله، وكتب إلى أهل مسجد الضرار يأمرهم ببناء المسجد الذي كانوا بنوه فيما ذكر عنه ليصلي فيه، فيما يزعم إذا رجع إليهم ففعلوا ذلك، وهذا معنى قول الله تعالى "وإرصادا لمن حارب الله ورسوله من قبل".