فتح المركز الجامعي لعين تموشنت، خلال السنة الجامعية الحالية 2012 - 2013، 10 مسارات في تخصصات الماستر لفائدة طلبتها الحائزين على شهادة الليسانس، وتتوافق تخصصات الماستر مع احتياجات سوق الشغل وأيضا مع أمنيات الطلبة وفق المعدلات التي تحصلوا عليها في دراساتهم، حيث أن الاختيار الأول لكل الطلبة قد تحقق في بعض المسارات.