تم تأسيس (منحة محمد اركون لرسالة الدكتوراه) بمبادرة من معهد الدراسات الاسماعيلية التي يرأسها الأمير آغا خان (اعترافا بإسهامات البروفيسور محمد اركون في ميدان الدراسات الإسلامية والاختصاصات المرتبطة بها) حسبما علم يوم الخميس من أقارب هذا المختص الجزائري في الدراسات الإسلامية الذي تعدت شهرته الأفاق· وتغطي هذه المنحة الدراسية لتحضير رسالة الدكتوراة مدة أربع سنوات اكاديمية متتالية· وهي مخصصة للطالب الذي يحضر رسالة الدكتوراه ويجري أبحاثا في الدراسات الإسلامية ومن الأفضل حول مسألة أو مجال مرتبط بعمل البروفيسور اركون والتي يمكن أن تتضمن مسائل على غرار (إيلاء اهتمام خاص بالتاريخ والمسائل المعاصرة في المجتمع والفكر والمجتمعات الإسلامية و(اللجوء إلى أدوات العلوم الإنسانية والاجتماعية (سيما اللسانية والاجتماعية والانثربولوجية) في دراسة فكر المجتمعات المسلمة)·