Le département de l'Agriculture et du développement rural s'est doté de trois fonds spéciaux destinés essentiellement au développement du secteur. Les modalités de fonctionnement de ces derniers sont fixées par des décrets exécutifs publiés dans le dernier numéro du journal officiel datant du 7 mars. En plus des budgets sectoriels, d'autres sources de financement sont opérationnelles pour soutenir les projets de proximité de développement rural intégré (PPDRI) au titre de la lutte contre la désertification, le développement du pastoralisme et de la steppe (FLDDPS) et le Fonds de développement rural et de la mise en valeur des terres par la concession (FDRMVTC). Il s'agit donc de fonds spécial d'appui aux éleveurs et petits exploitants agricoles qui va assurer la couverture totale des charges d'intérêts des éleveurs et petits exploitants, ainsi que des petites exploitations agricoles dans les zones montagneuses et steppiques. Ledit fonds a également pour objectif de soutenir l'exploitation familiale et améliorer leurs revenus. Sont éligibles au soutien du compte d'affectation spéciale du Fonds spécial d'appui aux éleveurs et petits exploitants agricoles : les éleveurs et les petits exploitants agricoles à titre individuel ou organisés en coopératives, groupements ou associations. Le second fonds institué par le ministère de l'Agriculture est le Fonds de lutte contre la désertification et le développement du pastoralisme et de la steppe. La lutte contre la désertification et le développement du pastoralisme sont une des priorités des pouvoirs publics eu égard à l'étendue des parcours steppiques, à leur dégradation et à la nécessité de sauvegarder une économie pastorale fondée sur l'élevage du mouton. Le troisième fonds est destiné au développement rural et à la mise en valeur des terres par la concession.