Depuis la mort d'Oussama Ben Laden, le 2 mai 2011, plusieurs hauts dirigeants d'Al-Qaïda ont été tués à travers le monde, à l'instar d'Abdelhamid Abou Zeïd et Mokhtar Belmokhtar, deux figures d'Aqmi dont la mort a été annoncée par le Tchad. 2011 2 mai : Oussama Ben Laden tué au Pakistan après dix ans de traque, lors d'une opération des forces spéciales américaines contre la résidence où il se cachait à Abbottabad, ville-garnison proche d'Islamabad. Le 16 juin, l'Egyptien Ayman Al-Zawahiri est désigné pour le remplacer à la tête de l'organisation. 8 juin : Le chef d'Al-Qaïda en Afrique de l'Est, le Comorien Fazul Abdullah Muhammad, un des acteurs-clés des attentats anti-américains de 1998 à Naïrobi et Dar Essalam, est tué lors d'une fusillade en Somalie. 22 août : Le numéro deux d'Al-Qaïda, Atiyah abd al-Rahman, est tué au Pakistan, par une frappe de drone américain dans la zone tribale du Waziristan (Nord-Ouest). 30 septembre : Anwar al-Aulaqi, imam radical américano-yéménite lié à Al-Qaïda et ennemi public de Washington, est tué au Yémen par une frappe de drone de la CIA. Aulaqi était soupçonné par Washington de liens avec le Nigérian Umar Farouk Abdulmutallab, auteur de l'attentat manqué du 25 décembre 2009 sur un avion de ligne américain. 2012 9 février : Le chef d'Al-Qaïda au Pakistan, Badar Mansoor, est tué par un tir de drone américain dans son camp d'entraînement à Miranshah, principale ville du district tribal du Waziristan du Nord. 6 mai : Un chef d'Al-Qaïda dans la Péninsule arabique (Aqpa), Fahd al-Quso, est tué dans un raid aérien attribué aux Etats-Unis dans le sud du Yémen. Fahd al-Quso était recherché par les Etats-Unis pour son implication dans l'attentat contre l'USS Cole, qui avait tué 17 marins américains en 2000 dans le golfe d'Aden. 29 mai : L'Isaf, force armée de l'Otan en Afghanistan, affirme avoir tué dans un bombardement Sakhr al-Taifi, un Saoudien également connu sous le nom de Mushtaq and Nasim, considéré comme le deuxième plus haut responsable d'Al-Qaïda en Afghanistan. 5 juin : Les Etats-Unis annoncent la mort du numéro deux d'Al-Qaïda, le Libyen Abou Yahya al-Libi, tué dans une frappe de drone dans les zones tribales du nord-ouest du Pakistan. 2013 25 janvier : La plus haute autorité de sécurité au Yémen, le Comité national supérieur de sécurité, annonce la mort du Saoudien Saïd al-Chehri, cofondateur et numéro deux d'Al-Qaïda dans la péninsule arabique (Aqpa). Il aurait succombé à ses blessures après une opération militaire le 28 novembre 2012 dans la province de Saada (Nord). 1er mars : Le président tchadien Idriss Déby annonce la mort de l'Algérien Abdelhamid Abou Zeïd, un des principaux chefs d'Al-Qaïda au Maghreb islamique (Aqmi), tué par des troupes tchadiennes lors d'affrontements dans le massif des Ifoghas (nord du Mali). 3 mars : L'armée tchadienne annonce avoir tué Mokhtar Belmokhtar, chef historique d'Aqmi, entré ensuite en dissidence, qui a revendiqué l'attaque suivie d'une prise d'otages menée du 16 au 19 janvier contre le site gazier algérien d'In Amenas. 37 étrangers et un Algérien ont été tués ainsi que 29 assaillants dans l'attaque et sa répression par l'Armée algérienne. Ces deux morts n'ont pas été confirmées par d'autres sources officielles.