بدأت شركتا Apple وGoogle في حظر جميع التطبيقات التي تحمل اسم Flappy، من متجري Appstore وGoogle Play، وذلك بعد ظهور عدد من التطبيقات التي تحمل برمجيات خبيثة تحمل نفس الاسم. وكان عدد من المطورين استغلوا الشهرة الكبيرة التي حققتها لعبة Flappy Bird، والتي تم حذفها نهائياً من متجري Appstore وGoogle Play، لإطلاق تطبيقات شبيهة بها تحتوى على برمجيات خبيثة تستهدف عشاق اللعبة. وقررت شركتا Apple وGoogle عدم الموافقة كذلك على أي طلبات لنشر تطبيقات جديدة تحمل نفس اسم اللعبة المحذوفة أو جزء من الاسم على متجري Appstore أو Google Play، إضافة إلى حذف التطبيقات المتضمنة اسم Flappy والمتواجدة فعلياً على المتجرين. واضطر العشرات من مطوري التطبيقات سواء لنظام Android أو iOS إلى تغيير أسماء تطبيقاتهم، بما فيها التطبيقات التي لا تنطوي على أي تهديدات أو برمجيات خبيثة، وذلك لضمان استمرار تواجدها على متجري تطبيقات الأجهزة الذكية. يذكر أن التطبيقات الخبيثة التي تم نشرها عقب حذف لعبة Flappy Bird من متجري Appstore وGoogle Play كانت تستهدف سرقة المعلومات الخاصة بمستخدمي الأجهزة الذكية، إضافة إلى استغلال صلاحية إرسال الرسائل النصية لتنفيذ أوامر مثل إرسال رسائل نصية قصيرة لأرقام محددة دون علم مالك الهاتف، وهي الأرقام التي تستقطع جزء من رصيد المستخدم مع كل رسالة. وتجدر الإشارة إلى أن مطور لعبة Flappy Bird الأصلي كان قد قرر سحب التطبيق نهائياً من متجري Appstore وPlaystore رغم شعبيته الكبيرة، وبعد أن تجاوز 50 مليون عملية تثبيت خلال أيام قليلة، مبرراً قراره بأن اللعبة كانت تسبب إدمان المستخدمين عليها.