الحركة الشعبية لتحرير السودان انجرت رغما عنها إلى تطبيق مبادئ اللعبة الدولية الرامية إلى تجزئة السودان وراحت تتصرف في الجنوب ألسوداني ككيان منفصل رغم اتفاقية السلام المبرمة مع الحكومة المركزية في الخرطوم ،وفتحت الباب واسعا أمام التدخلات الدولية، في ظل احتدام أزمة إقليم دارفور ووصولها إلى المحكمة الجنائية الدولية.. و تجدد خلافات الحركة الشيعية مع القيادة السودانية حول تطبيق بعض بنود اتفاق سلام الجنوب، والذي يقضي بانسحاب القوات الشمالية من المواقع التي تتمركز بها في الجنوب ومصير منطقة (ابيي) الواقعة بين الشمال والجنوب، ويتنازع عليها الجانبان ... أفرغ اتفاقية السلام التي تعد نموذجا مثاليا يحتذى به في حسم الصراعات الأهلية من ايجابياتها . فوحدة السودان تهددها التجزئة التي تسعى إليها بعض القوى الدولية بعد اكتشاف النفط من قبل شركة شيفرون الأمريكية في جنوب السودان عام 1978..ووضعت باكتشافها حدا للصراع التقليدي على الماء في جنبات الصحراء الكبرى ونصبت مواقع صراع أخر لم تعرفه المنطقة من قبل... وجامعة الدول العربية التي لا تخفي قلقها الشديد إزاء التوتر الذي تشهده العلاقة بين شريكي اتفاق السلام في جنوب السودان، باعتبارها شاهدًا على اتفاق السلام الشامل تأخذ مطالبتها بالعودة إلى الحوار لحل الخلافات العالقة ومواصلة تنفيذ البنود المتبقية من الاتفاق،ِكحل مناسب لإعادة طرفي النزاع مجددًا إلى طاولة المباحثات ومعالجة القضايا العالقة بالتنسيق مع الشركاء الدوليين الذين شهدوا توقيع الاتفاق لحل القضايا الخلافية من خلال شراكة كاملة بين الجانبين. لكن تجاوب الحركة الشعبية لتحرير السودان (حركة التمرد الجنوبية سابقاً) مع القوى الكبرى المتنفذة في العالم، بسبب خلافات مع الشماليين حتى يتم حل الخلافات العالقة بين الشريكين وتطبيق اتفاق السلام الشامل، الذي ابرم مطلع العام 2005 وأنهى حربًا أهلية دامت لأكثر من عقدين بين الشمال والجنوب ...أعاد الأوضاع إلى نقطة الصفر وجعل من الانفصال خيارا يقترب من التنفيذ بدعم دولي يمهد لانفصال دارفور لاحقا ..في ظل فشل تسوية الخلافات" بين الحركة الشعبية وحزب المؤتمر الوطني الحاكم الذي يتزعمه الرئيس عمر حسن البشير... اتفاقية السلام المثالي في خارطة الحروب الأهلية.. جمدت والتحرك المصري لم يؤثر في من يرفض القبول بدور عربي، والتحرك الليبي الذي تحول إلى أخلاقيات افريقية ، أخذ في خاتمته شكل دعوة أطلقتها أطراف النزاع لتدخل دولي يحسم صراعا داخليا فجرته اكتشافات نفطية، وضعت سيادة السودان في مهب الريح .