Duveyrier, qui a recueilli les traditions relatives aux origines de Djanet, pense que Goma et les Imanan sont arrivés dans le Tassili dans la seconde moitié du XVIIe siècle. On pense que Djanet existe avant ces faits, bien que les auteurs musulmans fassent allusion à elle avant le XIVe siècle. Au XIIe siècle, El-Idrissi parle des Touareg Ajjers, dont il donne la forme ancienne du nom, Azgar, il situe leur territoire dans la montagne du Tantano (Tassili) et cite les localités avec lesquelles ils étaient en relation, comme Ghadames et Tessawa, mais il ne mentionne pas Djanet. On peut supposer, avec M. Hachid (1995), que Djanet, en raison de sa situation sur un plateau d'accès difficile, était contournée par le Sud, beaucoup plus accessible. C'est Ibn Battouta qui, au XIVe siècle, fera allusion, pour la première fois, à Djanet. Le célèbre globe-trotter marocain écrit que lors de son séjour dans l'Aïr, à Takedda, il a résidé chez le cadi de la ville, un certain Abû Ishaq al-Djânâtî, nom signifiant «originaire de Djanet». Au XVIIe siècle, Djanet est dominée par les Imenans : elle formait, avec Ghat, l'une des résidences du sultan Goma qui régnait sur tout l'Ahaggar et l'Aïr.