Un programme prioritaire d'aménagement des systèmes de collecte et d'épuration des eaux usées et d'évacuation des eaux pluviales et de protection contre les inondations des agglomérations vulnérables, a été déjà élaboré et devra être lancé dans les prochains mois. D'un montant de 8 milliards de dinars, ce programme prévoit la réalisation de 36,3 km d'intercepteurs et conduites de refoulement pour la collecte et l'évacuation des eaux usées vers la station d'épuration en cours de réalisation dans la localité de Sidi Salem, à l'est de la ville de Annaba. La collecte et l'évacuation de ces eaux se feront par l'intermédiaire des stations de relevage, dont 8 ont été programmées pour bénéficier de travaux d'extension et de renforcement. Ces intercepteurs seront réalisés au niveau de la zone côtière, du centre-ville et des cités Plaine Ouest et Rym de Annaba. S'agissant de la lutte contre les inondations, ce programme prévoit , selon la direction de l'hydraulique de la wilaya de Annaba, outre l'aménagement du réseau hydrographique, la réalisation d'un barrage écréteur et d'ouvrages de rétention, une étude hydrologique hydraulique des crues de Oued Boudjamaâ en vue de la valorisation urbaine, et une autre consacrée à la gestion des précipitations extrêmes dans la basse ville de Annaba .Une société par actions (SPA), dirigée par un opérateur allemand, spécialisée et qualifiée en la matière, sera opérationnelle d'ici la fin de l'année 2007 dans le but d'assurer le transfert des connaissances et du savoir et de mettre en place les mécanismes d'exploitation performants et modernes. Le système d'assainissement, à l'échelle de la wilaya, comporte près de 1 000 km de collecteurs, plus de 20 km de réseau hydrographique urbain, et 31 stations de relevage dont 14 implantées au niveau du chef-lieu de wilaya.