تضاربت الانباء حول سبب اغتيال القائد العسكري لثوار ليبيا عبد الفتاح يونس بين تأكيدات بأن مقتله جاء بأيدي الثوار الذين تيقنوا من أنه يعمل لصالح القذافي وأخرى ترى أن الزعيم الليبي يقف خلف اغتيال يونس لإضعاف الثورة الليبية. فقد قال المتحدث باسم حزب ليبيا الديمقراطي صبري مالك "إن الثوار الليبيين هم من قتلوا عبد الفتاح يونس بسبب شكوك حول قيامه بالعمل لصالح القذافي". وقال مالك "إن عبد الفتاح يونس لم يكن محط ثقة الشعب الليبي منذ البداية، حيث عمل مع العقيد معمر القذافي لمدة 42 عاما وكان شديد الولاء والإخلاص له". وأضاف مالك أنه "بالرغم من انشقاق يونس عن نظام القذافي وانضمامه إلى صفوف الثوار، إلا أن الشكوك كانت تحيط به من أنه كان يعمل لحساب القذافي، ولذلك قرر مقاتلو ليبيا الأحرار التخلص منه". وأوضح أن "المشكلة كانت تتمثل في وجود أحد رجال القذافي داخل قيادة المجلس الانتقالي الليبي، مما يجعل المجلس ضعيفا ويفتقر إلى الشرعية السياسية، الأمر الذي يجعل ليبيا عرضة لنشوب حرب أهلية بسهولة". وفي معرض تعليقها على اغتيال يونس، قال موسى إبراهيم الناطق باسم الحكومة الليبية، إن حادث اغتيال اللواء عبد الفتاح يونس يثبت ان الحكومة البريطانية ارتكبت خطأ كبيرا باعترافها بالمجلس الانتقالي المعارض كممثل وحيد للشعب الليبي. واضاف ابراهيم "إن اغتيال يونس صفعة للبريطانيين، لأن المجلس الذي اعترفوا به لا يتمكن حتى من حماية قائد جيشه". وقال ابراهيم إن تنظيم القاعدة هو الذي قتل اللواء يونس، مؤكدا ان التنظيم يمثل اقوى فصيل في حركة المعارضة. واضاف: "لقد كان هدف تنظيم القاعدة بهذا العمل تأكيد وجوده والنفوذ الذي يتمتع به في المنطقة الشرقية". وقال: "إن اعضاء المجلس الانتقالي يعرفون ذلك جيدا، ولكنهم لم يتمكنوا من الردّ لأنهم يخافون من القاعدة".