تم بموجب مرسوم تنفيذي مؤرخ في 10 نوفمبر 2007 تعديل مرسوم إنشاء الوكالة الوطنية لإنجاز مسجد الجزائر العاصمة وتسييره، وقد مس التعديل المادة التاسعة التي تنص على تشكيلة مجلس الإدارة الذي يرأسه وزير الشؤون الدينية والأوقاف، حيث أضيف إلى التشكيلة ممثل عن وزير الدفاع الوطني وممثل آخر عن وزير الداخلية والجماعات المحلية إضافة إلى تغيير تسمية المسجد من "مسجد الجزائر العاصمة" إلى "جامع الجزائر".