L'Algérie participera avec 4 clubs en Coupe d'Afrique des clubs de 2006. Le champion et le vice-champion prendront part à la Ligue des champions tandis que le vainqueur de la Coupe d'Algérie et le club classé 3e ou 4e au championnat de division Une joueront la Coupe de la confédération. Signalons que la FAF a eu droit à ce nombre grâce à sa présence dans le top des douze meilleurs pays des compétitions des clubs. Dans ce classement, que la CAF actualise annuellement, l'Algérie occupe la 4e place derrière l'Egypte (1re), la Tunisie et le Nigeria et devant le Cameroun, le Ghana, la Côte Ivoire, le Maroc, l'Afrique du Sud, l'Angola, le Sénégal et la RD Congo. Concernant la Champions League arabe, le nombre de clubs algériens qui sera retenu par l'Union arabe de football sera communiqué après la publication du classement FIFA du mois de juin.
