Au début de l'année universitaire 2007-2008, 844 diplômés du nouveau système LMD (licence-master-doctorat) se sont inscrits en post-graduation à l'université Badji Mokhtar de Annaba, à la faveur de l'ouverture de 42 offres de formation de master agréées. Outre les mathématiques, l'électronique, la physique, la chimie, la biochimie microbiologique et l'électromécanique, ces formations englobent également d'autres spécialités telles que l'hydraulique, les génies des procédés, les mines et les sciences de la terre. A titre exceptionnel, il a été décidé, pour cette année, que tous les étudiants ayant acquis leurs diplômes de licence dans le cadre du nouveau régime peuvent s'inscrire en première année de master sans conditions. Par ailleurs, l'université Badji Mokhtar de Annaba va proposer, pour la prochaine rentrée 2008-2009, l'accès au master pour les étudiants titulaires de diplômes de formation classique après étude des dossiers et équivalences effectuées par des équipes pédagogiques. Un taux de 10 à 20 % maximum de l'effectif global des candidats postulant à cette formation sera retenu, et parmi ces derniers les licenciés du système LMD auront l'avantage en nombre. D'autres décisions sont également prévues pour la prochaine rentrée, dans le but de permettre une mobilité des étudiants. A titre d'exemple, les titulaires des diplômes DEUA peuvent accéder au cycle licence, nouveau régime (2e ou 3e année LMD 2 ou LMD 3). Les titulaires des diplômes de licence classique de 4 années, DES et ingéniorat peuvent accéder au cycle master (1ère ou 2e année, master 1 ou master 2), selon l'étude des dossiers. L'université Badji Mokhtar a accueilli cette année 46 505 étudiants, dont 31 762 inscrits en cycle long classique, 357 en cycle court, 13 542 en LMD et 844 en master.