Les médecins musulmans prescrivaient le clou de girofle pour ses propriétés stimulantes et surtout sédatives. On retrouve chez eux ce remède des algies dentaires, connu des Chinois et des Indiens : un clou de girofle pilé et placé sur la dent. Ibn Sîna la prescrivait pour renforcer l'acuité visuelle. Le même médecin et d'autres avant lui pensaient aussi qu'il renforçait l'estomac et le foie. Ish'aq Ibn Amrân pense qu'il excite l'instinct sexuel et qu'il favorise la procréation, mais selon la manière dont on l'utilise, il peut soit favoriser la grossesse, soit l'empêcher. Comme ailleurs, les médecins recommandaient la mastication du clou de girofle pour combattre la mauvaise haleine et purifier la bouche. La médecine moderne reconnaît les propriétés médicinales du clou de girofle. La plante comporte une quantité importante d'huile essentielle (jusqu'à 20%), ainsi que de l'eau, des tanins, de l'amidon et des fibres cellulosiques. Le principal constituant du clou de girofle est l'eugénol (l'huile en contient jusqu'à 85%), c'est un puissant antiseptique et bactéricide, que l'on emploie dans les cas de fermentations et d'infections intestinales, les affections pulmonaires, les plaies, les ulcérations, etc. L'eugénol a longtemps été utilisé par les dentistes comme anesthésiant avant qu'il ne soit remplacé par d'autres produits. Comme tonique, le clou de girofle combat la fatigue physique et intellectuelle, il renforce l'appétence sexuelle, ce qui justifie son utilisation aphrodisiaque chez les médecins musulmans. Cependant, l'abus du clou de girofle est toxique et il faut éviter son emploi chez les personnes fragiles (cas d'ulcère, grossesse, etc.)