Les fans de Comics s'étaient réjouis à l'annonce de son arrivée sur le projet. Mais Darren Aronofsky ne sera finalement pas aux commandes de The Wolverine. Le réalisateur américain a en effet dû abandonner la suite des aventures de Wolverine alors qu'il avait déjà rencontré Hugh Jackman et qu'il était prêt à démarrer la pré-production. Ce sont des raisons personnelles qui poussent le réalisateur de Black Swan à se retirer à la surprise générale. Sa décision est liée à sa récente rupture avec l'actrice Rachel Weisz qui annonce des discussions sur la garde de leur fils. Sachant que la quasi-totalité du film sera tournée au Japon et le reste au Canada, Darren Aronofsky ne pouvait pas se permettre de passer autant de temps en dehors des Etats-Unis. Dans un communiqué, la Fox se dit “déçue” mais “comprend et respecte” les raisons invoquées par le réalisateur.
