Pas moins de 30 conventions ont été signées jusqu'à ce jour entre l'université Badji Mokhtar de Annaba et ses homologues étrangères. Le plus grand nombre de conventions a été conclu avec les universités françaises, notamment Paris 13, Claude Bernard Lyon et les universités de technologies de Compiègne, Bretagne Sud, Potiers et de Versailles. Avec les pays arabes, l'université Badji Mokhtar est liée avec 6 conventions (El Manar et Sfax de Tunisie, de Jordanie, institut des mines et université Halaouane d'Egypte et l'université nationale d'Anajah). Des universités du Niger, Italie, Canada, Russie, Ukraine et Suisse coopèrent, elles aussi, avec l'université de Annaba qui est liée, d'autre part, par des conventions avec des entreprises économiques telles Arcelor Mittal, El Bousten, Ferrovial et Fertial. Ces conventions permettent d'entreprendre et de réaliser des recherches en commun et d'échanger des délégations d'étudiants et d'enseignants dans le cadre de la préparation de thèses en post-graduation.
