Une autre méthode s'appuyant sur des éléments naturels est la lithothérapie, méthode qui utilise les minéraux pour soigner diverses affections. Il s'agit d'introduire dans l'organisme les différents oligoéléments, inclus dans le milieu naturel, le minerai et la pierre. Un des promoteurs de cette méthode, le médecin Claude Bergeret écrit : «Le choix des minéraux pour les affections à traiter est basé sur leur origine. on distingue sur la croûte terrestre deux grandes sortes de roches : les roches éruptives ou ignées et les roches sédimentaires. Les roches éruptives comprennent les roches effusives qui se sont refroidies rapidement à la surface du sol, comme l'obsidienne ou les laves qui sont réservées au traitement des ‘'organes-feu'' : cœur, vaisseaux, sang, poumon foie ; et les roches intrusives qui, elles, se sont refroidies très lentement en se cristallisant dans les profondeurs du sol comme le granite et les feldspaths qui intéressent les ‘'organes-terre'' : tissus de soutien, squelette et tube digestif. Les roches sédimentaires sont divisées, elles aussi, en deux catégories : celles qui affleurent le sol, comme le sable et le marbre, et qui sont indiquées pour les ‘'organes-eau'' : système urogénital, peau et système nerveux, et celles qui sont très profondément enfouies, à la façon des roches intrusives et où la pression et la chaleur ont déterminé des transformations cristallines, d'où leur nom de roches métamorphiques. Celles-ci ont les mêmes indications que les roches intrusives : tissus de soutien, squelette, tube digestif».
