يجري تنفيذ 207 مشروع وطني للبحث بجامعة باجي مختار بعنابة برسم السنة الجارية 2012 حسب ما علم لدى إدارة الجامعة . وتتناول هذه المشاريع البحثية أربعة محاور علمية كبرى تتعلق بالبيئة والتنمية المستدامة وعلوم المواد والصحة والبيوتكنولوجيا وتكنولوجيات الإعلام والاتصال حسب ما تمت الإشارة إليه. و قد تم إنجاز حوالي 30 بالمائة من مجموع هذه المشاريع في إطار شراكة مع قطاعات نشاط مختلفة كالصناعة والخدمات والجماعات المحلية . ومن جهة أخرى استفادت جامعة باجي مختار خلال سنة 2012 من مشاريع بحث أخرى تمت المصادقة عليها من طرف اللجنة الوطنية لتقييم مشاريع البحث الجامعي والوكالة الوطنية لتطوير البحث العلمي كما أشار إليه المسؤولون بذات الجامعة . وتخص هذه المشاريع مجالات تحليل المواد والتكنولوجيات الدقيقة (نانو تكنولوجيا) و الصحة و التعمير والتهيئة الحضرية وتطوير الموارد البشرية. و تضم جامعة باجي مختار التي تستقبل مجموع 50 ألف طالب يؤطرهم بيداغوجيا 2230 أستاذا و85 مخبرا للبحث العلمي من بينها 22 مخبرا تم اعتماده خلال السنة الجارية 2012.