وصفت الرئاسة التونسية ، ردود الفعل من قبل وسائل الإعلام، بشأن تصريحات الرئيس منصف المرزوقي، ب"سوء الفهم"، وقالت أن ما ورد في تلك الوسائل، استند لمصادر غير موثوقة وتحليلات مغلوطة، في محاولة لتصحيح ، ما بدر من المرزوقي في تصريحاته حول وضع الإسلاميين في الجزائر، مطلع التسعينات . وكان الرئيس التونسي، منصف المرزوقي، أوضح أن الجزائر أخطأت فيما وصفه الوقوف في وجه الإسلاميين بداية التسعينات، و حمل الحكومة ضمنيا مسؤولية التوجه الدامي الذي أخذته الأحداث، و يخالف تصريح المرزوقي تماما تصريحا سابقا للغنوشي حيا فيه تدخل الجيش الجزائري في تلك الفترة لأن "الجبهة الإسلامية للإنقاذ المحلة لم تتصرف بشكل حكيم"، . وعبرت رئاسة الجمهورية في بيان لها ، عن "استغرابها من المقالات والتعليقات التي نشرتها بعض الصحف العربية والتي قالت إنها "حرفت خطاب رئيس الجمهورية المنصف المرزوقي في ليبيا ولمحت إلى محاولة تدخل في الشأن الجزائري الداخلي"، مؤكدة أن "العلاقات التاريخية والإستراتيجية" التي تربط بين تونسوالجزائر، ضاربة في القدم ولا يمكن أن تمسها تحليلات مغلوطة تفتقر الى الموضوعية والمصادر الموثوقة. وشددت رئاسة الجمهورية من خلال البيان الذي نشرته وكالة الأنباء التونسية، على احترام تونس الكلي والمطلق لسيادة الشقيقة الجزائر رئيسا وحكومة وشعبا. بمثابة "ترقيع" لما بدر من المرزوقي، اذي ظهر أنه غير ملم بأصول ممارسة السياسة و الدبلوماسية بما يكفي ليكون رئيسا لبلد في حجم تونس، وحاولت الرئاسة التونسية تجاوز، زلة لسان المرزوقي، بإظهار أواصر الأخوة بين البلدين و الشعبين، وسارعت إلى كشف أن الرئيس عبد العزيز بوتفليقة سيزور تونس بمناسبة الاحتفال بالذكرى الأولى لثورة 14 جانفي، مذكرا بتصريح رئيس الجمهورية الذي أعلن فيه اعتزامه أداء زيارة للشقيقة الجزائر خلال الأسابيع القليلة المقبلة "إيمانا منه بأهمية العلاقات بين البلدين الشقيقين وسعيا منه لترسيخها وتطويرها". كما أكد البيان أن الرئيس منصف المرزوقي وافق يوم الاثنين على تعيين عبد القادر حجار بصفته سفيرا فوق العادة ومفوضا للجمهورية الجزائرية الديمقراطية الشعبية بناء على طلب وصل تونس اليوم.مشيرا أن هذه الموافقة "أتت لتتجاوز العرف الدبلوماسي الذي يتطلب ثمان وأربعين ساعة على الأقل لإتمام المصادقة وهو ما يؤكد تميز وعراقة العلاقات بين الشقيقتين تونسوالجزائر"، في خطوة يستشعر منها مدى تأسف الرئاسة التونسية حيال تصريحات المرزوقي، التي قدمت في وسائل الإعلام العالمية، أنها تدخل سافر في الشؤون الجزائر الداخلية . بعد ان قال المرزوقي في ليبيا، أنه "يجب تقبل حكم الأحزاب الإسلامية و عدم التفكير في منعها والتصدي لها كما حدث في الجزائر" في تسعينيات القرن الماضي ما أغرق البلاد في دوامة من العنف، مضيفا "لو أن الجزائريين تركوا المجال للإسلاميين في الوصول إلى السلطة لما سالت تلك الدماء الغزيرة ولما أزهقت تلك الأرواح".، بينما عاكس هذا التصريح ، وصف راشد الغنوشي، رئيس حركة النهضة التونسية أمس، علاقة تونس مع الجزائر، خصوصا بعدما زارها قبل فترة بأنها "جيدة، واستقبلت استقبالاً حافلاً من المسؤولين وعلى رأسهم رئيس الجمهورية عبد العزيز بوتفليقة، وأتوقع أن يزور رئيس الحكومة التونسية حمادي الجبالي الجزائر قريبا"، كما "أتوقع أن يزور عاصمة الاتحاد الأوروبي بروكسيل وعواصم خليجية وإسطنبول وعواصم أخرى". و يظهر التناقض الواضح بين أركان النظام التونسي الجديد بخصوص مسألة "الإسلاميين" في الجزائر، فراشد الغنوشي، زعيم حركة النهضة التونسية، صرح من نيويورك قبل أيام بأن الجبهة الإسلامية للإنقاذ ارتكبت خطأ عندما تجاهلت تماما الأقلية المؤثرة من العلمانيين والجيش. وأعاب على قادتها أنهم كانوا يريدون الاستئثار بالسلطة. ويرى الغنوشي، أن الإسلاميين في الجزائر ارتكبوا خطأ لأنهم تجاهلوا تماما الأقلية المؤثرة من العلمانيين والجيش ورجال الأعمال. وتسبب هذا الخطأ، حسبه، في ما أسماه الانقلاب على العملية الديمقراطية. كما أوضح الغنوشي أن الجزائر لا تزال إلى اليوم تعاني من تبعات خطأ الإسلاميين، ومن تدخل الجيش لوقف المسار الانتخابي. ويعتقد بأن تشكيل حكومة وحدة وطنية كفيل بتفادي ما حدث بالجزائر